Une étude britannique met en lumière l'importance d'une consommation accrue de fibres pour renforcer notre microbiome et freiner la prolifération des bactéries pathogènes. Le microbiome intestinal, un écosystème complexe peuplé de micro-organismes, joue un rôle crucial dans notre santé. Parmi ces micro-organismes, les Enterobacteriaceae, qui se trouvent à faible taux dans un intestin sain, deviennent problématiques lorsque leur population explose suite à une inflammation ou à des aliments contaminés. Cette surpopulation peut, dans les cas extrêmes, mettre notre vie en péril.
Une recherche récente, publiée dans la revue Nature Microbiology, a permis d'explorer les mécanismes de protection contre ces bactéries et les stratégies pour diminuer le risque d'infections. En utilisant des techniques avancées d'intelligence artificielle, les chercheurs ont analysé le microbiome de plus de 12,000 personnes issues de 45 pays, en se basant sur des échantillons de selles. Cette analyse a révélé que la composition du microbiome pouvait prédire la sensibilité d'un individu à la colonisation par les Enterobacteriaceae, et les résultats demeuraient cohérents, quel que soit l'état de santé ou la localisation des participants.
Protéger notre intestin grâce aux fibres
Parmi les constats majeurs, les scientifiques ont identifié 135 espèces de microbes intestinaux qui semblent jouer un rôle protecteur contre les infections à Enterobacteriaceae. De nombreuses bactéries du genre Faecalibacterium, reconnues pour leur capacité à dégrader les fibres alimentaires et produire des acides gras à chaîne courte, se sont distinguées. Ces composés bénéfiques contribuent à créer un environnement intestinal peu accueillant pour les agents pathogènes.
Le docteur Alexandre Almeida, chercheur à l'université de Cambridge et principal auteur de l'étude, souligne : « En consommant des fibres présentes dans les légumes, les haricots et les céréales complètes, nous offrons la matière première à nos bactéries intestinales pour produire des acides gras à chaîne courte, ce qui nous aide à nous protéger contre ces microbes nuisibles. »
À l'inverse, il semblerait que les probiotiques aient un effet limité sur la prévention des infections causées par ces bactéries. Les chercheurs notent que ces suppléments n'altèrent pas significativement l'environnement intestinal, ce qui réduit leur efficacité pour prévenir la colonisation.
Avec la croissance alarmante de la résistance aux antibiotiques, la prévention des infections devient cruciale. Par exemple, Klebsiella pneumoniae est à l'origine de maladies graves telles que la pneumonie et la méningite. Le docteur Almeida insiste : « La meilleure solution est de prévenir les infections en amont, et cela passe par la limitation des opportunités pour les bactéries pathogènes de se développer dans notre intestin. »
Comprendre les interactions microbiennes
Cette étude remet en question certaines idée préconçues issues d'anciennes recherches sur les souris. Les résultats montrent que 172 espèces de microbes intestinaux peuvent coexister harmonieusement avec les Enterobacteriaceae pathogènes. Ces espèces partagent souvent des besoins nutritionnels similaires avec les bactéries nuisibles, rendant leur élimination par simple compétition pour les nutriments plus complexe.
Le docteur Qi Yin, chercheur à l'université de Cambridge et auteur principal du rapport, souligne : « Ces résultats révèlent l'importance d'étudier les agents pathogènes dans le contexte de leur microbiome intestinal environnant, plutôt que comme des entités isolées. »
